| 1 | Erik Sorga
FC Flora | FC Flora | 34 | 29 |
| 2 | Alassana Jatta
Paide Linnameeskond | Paide Linnameeskond | 17 | 13 |
| - | Nikita Andrejev
FCI Levadia Tallinn | FCI Levadia Tallinn | 34 | 13 |
| - | Eric McWoods
JK Trans Narva | JK Trans Narva | 31 | 13 |
| - | Kaimar Saag
Tulevik Viljandi | Tulevik Viljandi | 34 | 13 |
| 6 | Herol Riiberg
FC Flora | FC Flora | 25 | 11 |
| - | Mark Oliver Roosnupp
FCI Levadia Tallinn | FCI Levadia Tallinn | 25 | 11 |
| - | Joao Morelli
FCI Levadia Tallinn | FCI Levadia Tallinn | 30 | 11 |
| - | Sten Reinkort
Tammeka Tartu | Tammeka Tartu | 36 | 11 |
| - | Yann Michael Yao
Paide Linnameeskond | Paide Linnameeskond | 29 | 11 |
| - | Konstantin Vassiljev
FC Flora | FC Flora | 32 | 11 |
| 12 | Yevhen Budnik
FCI Levadia Tallinn | FCI Levadia Tallinn | 14 | 10 |
| 13 | Max Mata
Kalju Nõmme | Kalju Nõmme | 14 | 9 |
| - | Liliu
Kalju Nõmme | Kalju Nõmme | 20 | 9 |
| - | Ander Valge
Paide Linnameeskond | Paide Linnameeskond | 29 | 9 |
| - | Marcelin Gando
FCI Levadia Tallinn | FCI Levadia Tallinn | 31 | 9 |
| - | Henri Välja
Paide Linnameeskond | Paide Linnameeskond | 31 | 9 |
| - | Aleksandr Zakarlyuka
JK Trans Narva | JK Trans Narva | 35 | 9 |
| - | Sander Sinilaid
Paide Linnameeskond | Paide Linnameeskond | 35 | 9 |
| - | Igor Subbotin
Kalju Nõmme | Kalju Nõmme | 33 | 9 |
| 21 | Markus Jürgenson
FCI Levadia Tallinn | FCI Levadia Tallinn | 32 | 8 |
| 22 | Eduard Golovljov
JK Trans Narva | JK Trans Narva | 19 | 7 |
| - | Wale Musa Alli
Kalev Tallinn | Kalev Tallinn | 33 | 7 |
| - | Märten Pajunurm
Kuressaare | Kuressaare | 34 | 7 |
| - | Andre Frolov
Paide Linnameeskond | Paide Linnameeskond | 35 | 7 |
| 26 | Frank Liivak
FC Flora | FC Flora | 31 | 6 |
| - | Kirill Nesterov
FCI Levadia Tallinn | FCI Levadia Tallinn | 24 | 6 |
| - | Maximiliano Uggè
Kalju Nõmme | Kalju Nõmme | 23 | 6 |
| - | Robert Kirss
Kalju Nõmme | Kalju Nõmme | 29 | 6 |
| - | Henrik Pürg
FC Flora | FC Flora | 29 | 6 |
| - | Tauno Tekko
Tammeka Tartu | Tammeka Tartu | 33 | 6 |
| 32 | Jasper Uwa
Maardu Linnameeskond | Maardu Linnameeskond | 7 | 5 |
| - | Aleksandr Volkov
Kalju Nõmme | Kalju Nõmme | 17 | 5 |
| - | Vladyslav Khomutov
Kalju Nõmme | Kalju Nõmme | 12 | 5 |
| - | Rainer Peips
Tulevik Viljandi | Tulevik Viljandi | 23 | 5 |
| - | Tristan Koskor
Tammeka Tartu | Tammeka Tartu | 16 | 5 |
| - | Patrick Veelma
Tammeka Tartu | Tammeka Tartu | 26 | 5 |
| - | Indrek Ilves
Tulevik Viljandi | Tulevik Viljandi | 26 | 5 |
| - | Rasmus Peetson
FCI Levadia Tallinn | FCI Levadia Tallinn | 25 | 5 |
| - | Mihkel Ainsalu
FC Flora | FC Flora | 26 | 5 |
| - | Martin Miller
FC Flora | FC Flora | 26 | 5 |
| - | Sander Puri
Kalju Nõmme | Kalju Nõmme | 28 | 5 |
| - | Vlasiy Sinyavskiy
FC Flora | FC Flora | 36 | 5 |
| - | Julius Kasparavicius
JK Trans Narva | JK Trans Narva | 29 | 5 |
| - | Kaspar Paur
Kalju Nõmme | Kalju Nõmme | 35 | 5 |
| - | Yevgeni Osipov
FCI Levadia Tallinn | FCI Levadia Tallinn | 30 | 5 |
| - | Mikel Barruetabena
Paide Linnameeskond | Paide Linnameeskond | 30 | 5 |
| - | Vitali Gussev
Maardu Linnameeskond | Maardu Linnameeskond | 33 | 5 |
| - | Sander Laht
Kuressaare | Kuressaare | 33 | 5 |
| - | Joseph Saliste
JK Trans Narva | JK Trans Narva | 35 | 5 |