Voor de tweede week op rij zijn de eerste twee startplekken voor Ducati. In San Marino -waar Ducati zich traditiegetrouw thuis voelt - was het wederom Francesco Bagnaia op P1 en Jack Miller op P2. De leider in het kampioenschap - Fabio Quartararo - maakt de eerste startrij compleet. Voor Marquez en Rossi was het wederom een teleurstellende kwalificatie, beide oud-wereldkampioenen gingen onderuit.